深圳市深港科技合作促进会成立于2011年，由深港两地关心和促进深港科技合作发展的相关团体、企业、知名人士等发起。促进会旨在发挥社会团体的积极作用，推进深港创新圈建设，组织深港两地科技界深入广泛的交流与合作。促进会面向深港两地公众和专业人士，开展学术活动、科技培训、科技咨询、科技评审、人才交流、科普活动、科技展示和推广等活动，有效有序地发挥两地优势，构建开放型区域创新体系。
成立以来，促进会参与中国工程院香港工程科学院联合课题调研，组织研究福田-落马洲河套协同创新发展、粤港澳大湾区创新平台建设、深港口岸改革、光明科学城发展战略等重大课题研究。通过举办专业论坛会议、推动青年协同创新发展、为香港青年拓展发展空间，引进香港创新资源落地及利用香港国际平台推动深圳企业走向国际舞台，为粤港澳大湾区建设发展献计献策等多方面开展工作，取得良好成效。相继举办了深港科技合作论坛、电子信息论坛、亚太经济峰会等专业会议，创办深港青年创业训练营、摇篮计划、数码港大湾区青年创业计划；组建并运营前海产学研孵化器、粤港澳青年创新创业工场（福田）、光明深港澳科技成果转移转化基地、深圳国资国企产业创新中心众创空间等创业孵化载体，发起和举办了深港澳青年创新创业大赛、大湾区IT应用开发大赛、高校校友创新创业大赛等活动。
促进会多次获深圳市科协年度优秀学会光荣称号，是粤港澳大湾区三地交流中知名度高，向心力强的社会团体，成为深圳发挥民间和社会力量开展深港合作的重要载体和平台。